La “Cell Factory G. Gaslini”

La Cell Factory è dotata di strumenti di ultima generazione per rendere possibili terapie cellulari personalizzate e innovative. Il sistema CliniMACS Prodigy, certificato CE, rappresenta il cuore tecnologico della struttura. Grazie a questo strumento, è possibile sviluppare terapie avanzate come:

• Produzione di cellule CAR-T, cellule dendritiche e cellule T virus-specifiche.
• Colture cellulari su misura per esigenze terapeutiche specifiche.
• Manipolazione ed arricchimento di particolari popolazioni cellulari.
• Un approccio integrato per garantire qualità e sicurezza

Oltre alla produzione, la Cell Factory si occupa della validazione dei processi produttivi, con controlli di qualità microbiologici e specifici per assicurare la sicurezza e l’efficacia delle terapie. Ogni fase, dal processo alla documentazione, è studiata per rispettare i più alti standard di affidabilità e innovazione.
Con il suo approccio flessibile e innovativo, la Cell Factory del Gaslini contribuisce al progetto COMETA portando la ricerca scientifica sempre più vicina alla pratica clinica, per un impatto reale sulla salute delle persone.

Università degli Studi di Genova

L’Università di Genova impiega tecnologie all’avanguardia per sostenere la ricerca e innovare nel campo farmaceutico e biomedico:

• Organoidi 3D: Modelli tridimensionali che simulano tessuti umani, fondamentali per studiare e testare nuovi farmaci.
• Micro e nanotecnologie: Sistemi innovativi sviluppati in collaborazione con UniCA per accelerare i processi di Drug Screening.
• Radiofarmaci avanzati: Un’infrastruttura dotata di ciclotrone permette la marcatura di farmaci con isotopi positrono-emittenti per applicazioni diagnostiche e terapeutiche.
• Piattaforme computazionali: Sistemi di intelligenza artificiale e gestione di Big Data per ottimizzare lo sviluppo di molecole e analizzare grandi quantità di dati in modo rapido ed efficace.

Punti di forza delle attività di ricerca nel progetto COMETA:

• Modelli 3D e pipeline computazionali: Sviluppo di strumenti avanzati per simulazioni precliniche ad alta precisione.
• Banca campioni unica: Raccolta e caratterizzazione di campioni clinici per sostenere la ricerca traslazionale.
• Tecnologie cellulari avanzate: Studio simultaneo di funzioni cellulari a livello di singola cellula per una comprensione più profonda dei meccanismi biologici.

CRS4

Il CRS4 contribuisce al progetto utilizzando e sviluppando metodi, strumenti e tecnologie altamente innovative qui di seguito elencate:

• Infrastruttura integrata per il sequenziamento massivo, potenziata nel corso del progetto ed utilizzata per la caratterizzazione genomica ed epigenomica dei campioni cellulari. In particolare, oltre alla tecnologia di sequenziamento di ultima generazione della Illumina con il NovaSeq X Plus, dotato delle pipelines Dragen on Board, nell’ambito del progetto COMETA è stato acquisito in noleggio lo strumento di sequenziamento “Long Read” Oxford Nanopore PromethION 24.
• Piattaforma NGS abbinata al centro di calcolo del CRS4, dotato di più di 8,000 core e GPU NVIDIA di ultima generazione. Il centro di calcolo per il progetto è stato potenziato con una infrastruttura aggiuntiva dedicata, consistente di 8 nuovi server di cui quattro GPU ready per una capacità totale di calcolo di 768 cores, e di storage (circa 1.4 PB su 8 nodi di tipo Isilon A300). L’infrastruttura computazionale opera con i più elevati standard di sicurezza informatica
• Piattaforma di digital pathology utilizzata in progetti internazionali. La piattaforma consente l’implementazione flessible, scalabile e intelligente per l’analisi e l’annotazione di immagini ad altissima risoluzione derivanti dalla scansione di vetrini diagnostici (Whole Slide Images, WSI). Abbinando algoritmi di intelligenza artificiale è possibile la realizzazione prototipale di strumenti di annotazione dedicati per ottenere una maggiore accuratezza, efficienza e coerenza nel processo di annotazione e sull’analisi computazionale basata su workflow con tracciamento integrato della provenance.
• Tecniche e strumenti HPC (High Performance Computing) per la simulazione modellistica e computazionale. Le tecniche adottate includono: a) tools di dinamica molecolare potenziati mediante approcci ab initio quantistici, tecniche di enhanced sampling, data mining ed intelligenza artificiale (OPES); b) tecniche di modellazione matematica, risoluzione numerica e simulazione computazionale per la descrizione meccanicistica dei fenomeni biologici.

Il CRS4, inoltre, nell’ambito del progetto è attivo nella formazione e trasferimento di competenze. Organizza scuole scientifiche internazionali di modellistica molecolare rivolte a studenti e ricercatori, incentrate su metodi emergenti di tipo “knowledge based” ed alla loro integrazione con quelli “physics-based”.